Suomen Akatemialta rahoitusta Jyväskylän yliopistoon kansainväliseen suurteholaskennan tutkimusyhteistyöhön

Rahoituksella vahvistetaan eurooppalaisenEuroHPC (European High-Performance Computing) -suurteholaskennan resurssien ja LUMI-supertietokoneen hyödyntämistä kansainvälisessä tutkimusyhteistyössä. Rahoituksella kehitetään monipuolista tulevaisuuden laskentaekosysteemiä ja laajennetaan siihen liittyvää osaamista sekä kansallisesti että kansainvälisesti.

Kemian professori Karoliina Honkala sai lähes 500 000 euron rahoituksen hankkeeseen, jossa tarkoituksena on luoda nopeutettuja ja tarkkoja simulaatiota bioalkoholien hapettumista ohjaavien tekijöiden selvittämiseksi. Hanke yhdistää kehittyneitä laskennallisen kemian menetelmiä, elektrokatalyysiä ja suurteholaskentaa tutkimaan alkoholien sähkökemiallista hapetusta vedyn ja orgaanisten arvoaineiden tuotannossa. Projektin tavoitteena on edistää elektrokatalyyttisten sovellusten kehitystä ymmärtämällä, miten sähkökemiallinen rajapinta ja reaktio-olosuhteet vaikuttavat tutkittavaan reaktioon.

Kemian professori Gerrit Groenhof sai noin 460 000 euron rahoituksen hankkeeseen, jossa tutkitaan molekyylidynamiikkaa eksplisiittisesti mallinnetuilla protoneilla eksaskaalan supertietokoneilla. Simulaatiossa lasketaan atomien rataa molekyylissa, esimerkiksi protoneissa. Tuloksia voidaan hyödyntää esimerkiksi lääkekehityksessä.

Tutkimus perustuu aiemmin kehitettyyn uudenlaiseen molekyylidynamiikan menetelmään, jossa protonien sidokset voivat katketa. Hankkeessa käytetään tätä menetelmää nykyaikaisilla supertietokoneilla kahden tärkeän rakennebiologian ongelman ratkaisemiseen: Miten biomolekyylit tunnistavat tai aistivat toisensa ja millä mekanismilla proteiinit voivat muuntaa kemiallista energiaa mekaaniseksi työksi.

Lisätietoja: 
Professori Karoliina Honkala, karoliina.honkala@jyu.fi

Professori Gerrit Groenhof, gerrit.x.groenhof@jyu.fi