Turun yliopiston koordinoimalle tohtoriverkostolle 4,4 miljoonan euron EU-rahoitus tulevaisuuden virusuhkien varhaiseen tunnistamiseen

Euroopan komissio on myöntänyt DETECTIVE-hankkeelle 4,4 miljoonan euron rahoituksen. Tässä Horizon Europe Marie Sklodowska-Curie Actions (MSCA) -tohtoriverkostossa koulutetaan 14 väitöskirjatutkijaa yhdistämään virologiaa, evoluutiogenomiikkaa, epidemiologiaa, diagnostiikkaa ja tekoälypohjaisia analytiikkamenetelmiä, jotta monimutkainen tutkimus- ja seurantadata voidaan muuntaa reaaliaikaiseksi, näyttöön perustuvaksi päätöksenteoksi.

– DETECTIVE hanke vahvistaa Euroopan maiden kykyä ennakoida, havaita ja reagoida tuleviin virusuhkiin mahdollisimman varhaisessa vaiheessa, vahvistaen pitkäjänteistä sopeutumiskykyämme ja kriisivalmiuttamme tulevien pandemioiden varalle, kertoo hanketta johtava virusopin professori Heli Harvala Turun yliopiston biolääketieteen laitokselta.

Kohti ennakoivaa epidemiaälyä

Uudet ja uudelleen ilmaantuvat virusinfektiot kuormittavat terveydenhuoltojärjestelmiä, taloutta ja yhteiskuntia Euroopassa. COVID-19-pandemia toikin hyvin esiin haasteita, joita epidemioiden diagnosointiin, seurantaan ja ennustamiseen liittyy: virusdiagnostiikka, infektioiden seuranta ja data-analytiikka ovat pirstoutuneita ja poikkitieteellinen osaaminen puutteellista. Yhdessä nämä rajoittavat Euroopan kykyä ennakoida ja hallita uusia virusuhkia, ja siten tekevät toiminnasta reaktiivista.

DETECTIVE vastaa haasteeseen kehittämällä koulutuksen ja tutkimuksen kokonaisuuden, joka kattaa koko ketjun patogeenin havaitsemisesta riskinarviointiin ja kansanterveydellisen sekä kliinisen päätöksenteon tukeen.

Hankkeessa hyödynnetään muun muassa NGS-rinnakkaissekvensointia, kudos- ja soluviljelymalleja, jätevesi- ja verenluovuttajaseurantaa sekä multi-omiikka-aineistoja. Näitä yhdistetään tekoälypohjaisiin analytiikka- ja epidemiamalleihin, joiden avulla voidaan tuottaa käytännön toimia tukevaa tietoa nopeasti muuttuvissa epidemiatilanteissa.

– DETECTIVE-hankkeen tehtävänä on kouluttaa uusi sukupolvi tutkijoita, jotka pystyvät havaitsemaan ilmaantuvia taudinaiheuttajia aikaisemmin, arvioimaan ketkä ovat suurimmassa riskissä ja yhdistelemään eri lähteistä koottua tietoa reaaliaikaisiksi, todistuspohjaisiksi päätöksiksi, sanoo hollantilainen DETECTIVE-hankkeen koulutuksesta vastaava tohtori Kim Benschop.

14 väitöskirjatutkijaa viidessä maassa – tiivis yhteistyö yliopistojen, viranomaisten ja teollisuuden välillä

DETECTIVE on monialainen ja monisektorinen verkosto, jossa on mukana 8 jäsenorganisaatiota ja 14 yhteistyökumppania viidestä Euroopan maasta. Verkosto kouluttaa yhteensä 14 väitöskirjatutkijaa viidessä maassa: Suomessa (5), Alankomaissa (3), Tanskassa (1), Espanjassa (2) ja Isossa-Britanniassa (3).

Turun yliopiston lisäksi, DETECTIVE-hankkeen jäseninä ovat myös Tampereen yliopisto Suomessa, Nordsjællandin sairaala ja Kööpenhaminan yliopisto Tanskassa, Amsterdamin yliopiston lääketieteellinen keskus ja Alankomaiden kansanterveys- ja ympäristöinstituutti, Barcelonan Vall d’Hebronin yliopistosairaala Espanjassa sekä Glasgow’n yliopisto ja University College London Yhdistyneessä Kuningaskunnassa. Tiivis yhteistyö teollisuus-, akateemisten ja ei-akateemisten kumppaneiden välillä vahvistaa DETECTIVE-konsortion ulottuvuutta.

– DETECTIVE-hanke rakentuu Euroopan enterovirusverkoston (ENPEN) pohjalta, jonka perustin yhdessä tanskalaisen professori Thea Fischerin ja virologian dosentti Eeva Brobergin kanssa 10 vuotta sitten. DETECTIVE rakentuu siten vankalle perustalle, ja odotan innolla, että voimme jatkaa pitkäaikaisen yhteistyömme kehittämistä tästä, sanoo professori Harvala.

Koulutusohjelma kouluttaa uuden sukupolven virusasiantuntijoita, jotka pystyvät yhdistämään laboratoriotieteen, data-analytiikan ja kansanterveyden käytännöt. Tavoitteena on kehittää uusia työkaluja, standardeja ja päätöksentekorakenteita, joiden kautta voidaan vahvistaa Euroopan valmiuksia vastata uusiin terveysuhkiin nopeasti ja koordinoidusti.