Ruoansulatuskanavan syövistä löytyi uusi geenimuutoksia aiheuttava mekanismi

Helsingin yliopistossa toimivaa Suomen Akatemian Syöpägenetiikan huippututkimuksen yksikköä johtavan akatemiaprofessori Lauri Aaltosen ja professori Jussi Taipaleen johtamassa tutkimuksessa havaittiin, että CTCF-proteiinia sitovat genomin kohdat mutatoituvat poikkeuksellisesti paksusuolen syövissä.

Tutkijat tarkastelivat yli kahdensadan paksusuolisyöpää sairastavan potilaan genomeja ja havaitsivat, että tietyissä hypermutatoivissa kasvaimissa CTCF-proteiinin sitoumakohtiin kerääntyy vain vähän mutaatioita, kun taas toisessa kasvainryhmässä sitoumakohtiin kerääntyy poikkeuksellisen paljon juuri tietyntyyppisiä mutaatioita.

CTCF on tärkeä geenien ilmentymistä ja genomin rakennetta säätelevä proteiini, ja sen oikean genomiin sitoutumisen uskotaan olevan tärkeä tekijä syövän kasvussa. Tutkimus antoi viitteitä, että nyt havaittu ilmiö esiintyy usein tunnettujen syöpägeenien, kuten TP53 ja BRAF, mutaatioiden kanssa, mutta havaitun ilmiön täsmälliset syyt ja seuraukset ovat tärkeitä jatkotutkimusten aiheita.

Sitä genomin osaa, joka ei koodaa proteiineja, on tutkittu syöpägenetiikassa varsin vähän. Ei-koodaava alue voi kuitenkin sisältää paljon sellaisia muutoksia, joilla on merkitystä syöpäkasvaimen kehittymisessä.

– Tutkimuksemme tulos oli täysin odottamaton; löytämämme säätelyalueet ovat yhtä usein geenimutaatioiden kohteina kuin varsinaiset tunnetut syöpägeenit. Löydös on erittäin merkittävä ja paljastaa syöpägenomin toiset kasvot – tutkijoilla riittää kuitenkin vielä työtä muutosten syiden ja seurausten ymmärtämisessä, Aaltonen sanoo.

Nature Genetics -lehdessä 8.6.2015 julkaistua tutkimusta rahoittivat muun muassa Jane ja Aatos Erkon säätiö ja Suomen Akatemia.

Lisätietoja:

Akatemiaprofessori Lauri Aaltonen
Puh. 040 443 5041
Sähköposti: lauri.aaltonen@helsinki.fi

Viite: Riku Katainen*, Kashyap Dave*, Esa Pitkänen*, Kimmo Palin*, Teemu Kivioja, Niko Välimäki, Alexandra E Gylfe, Heikki Ristolainen, Ulrika A Hänninen, Tatiana Cajuso, Johanna Kondelin, Tomas Tanskanen, Jukka-Pekka Mecklin, Heikki Järvinen, Laura Renkonen-Sinisalo, Anna Lepistö, Eevi Kaasinen, Outi Kilpivaara, Sari Tuupanen, Martin Enge, Jussi Taipale & Lauri A Aaltonen 'CTCF/cohesin-binding sites are frequently mutated in cancer' Nature Genetics   http://dx.doi.org/10.1038/ng.3335

* These authors contributed equally to the work

**********************************
Ystävällisin terveisin

Päivi Lehtinen, tiedottaja, Helsingin yliopisto / Academic Medical Center Helsinki (AMCH)
paivi.m.lehtinen@helsinki.fi  050 406 2043