Koneoppiminen auttaa ennustamaan leukemian uusiutumista kantasolusiirron jälkeen
SPR Veripalvelu on tutkimuksessaan kartoittanut kantasolusiirron saaneiden potilaiden perimän vaihtelun merkitystä hoidon lopputulokseen. Tulokset antavat viitteitä siitä, että potilaan genomitietoa ja koneoppimista voitaisiin hyödyntää kantasolusiirron riskien arvioinnissa yhä laajemmin.
Veren kantasolujen siirtoa käytetään viimesijaisena hoitokeinona nopeasti eteneviin hematologisiin syöpiin, joihin syöpälääkkeet eivät tehoa. Onnistuneessa allogeenisessa kantasolusiirtohoidossa luovuttajan luuydin korvaa potilaan oman luuytimen ja immuunijärjestelmän tuhoten samalla pahanlaatuiset kasvainsolut.
Vaikka hoitovaste on jatkuvasti parantunut, on kantasolusiirto edelleen vaativa ja vaarallinen toimenpide, jossa hengenvaaralliset komplikaatiot kuten käänteishyljintä tai taudin uusiminen ovat yleisiä. Noin kolmanneksella potilaista syöpä uusii muuten suotuisasta siirrosta huolimatta, eikä tällä hetkellä ole olemassa hyviä genomitietoon pohjautuvia työkaluja ennustaa taudin uusimista.
Luo pohjaa entistä yksilöllisemmälle hoidolle
Veripalvelussa, jossa kaikki ennen siirtoa tehtävät potilaan ja luovuttajan väliset sopivuuskokeet tehdään, on nyt tutkittu siirteen saajan perintötekijöiden osuutta taudin uusimisriskiin. Tutkimuksessa yli 500:n Suomessa kantasolusiirteen saaneen potilaan perimän vaihtelu määritettiin sekvensoimalla ja DNA-sirun avulla.
Vaihtelun yhteyttä taudin uusimiseen hoidon jälkeen tutkittiin laskennallisin ja tilastollisin menetelmin pyrkien huomioimaan esimerkiksi iästä tai siirretyypistä johtuva vaihtelu lopputuloksessa. Potilaat saivat siirteen sisarukseltaan. Koneoppimismalli luotiin 150 potilaan suuruisessa otoksessa ja sen luotettavuutta arvioitiin edelleen kahdessa riippumattomassa potilassarjassa.
Tulosten perusteella tiettyjen perintötekijöiden ja siirronjälkeisen syövän uusiutumisen välillä esiintyy tilastollinen yhteys. Tulevaisuudessa perintötekijöiden jatkotutkimukset voivat auttaa taudin mekanismien selvittämisessä ja potilaan riskin tarkemmassa arvioinnissa.
- Genomitietoa käyttämällä voimme Veripalvelussa jatkossa kehittää yhä parempia kantasolusiirron onnistumista ennakoivia testejä nykyisten rinnalle, toteaa tutkimusjohtaja Jukka Partanen.
Tutkimusprojekti on Suomen Akatemian rahoittama, ja nyt saadut ensimmäiset tulokset on julkaistu alan johtavassa Leukemia-lehdessä. Tutkimus J Ritari ym: Genomic prediction of relapse in recipients of allogeneic haematopoietic stem cell transplantation on luettavissa täältä.
Avainsanat
Yhteyshenkilöt
Jukka Partanen, tutkimusjohtaja, Suomen Punaisen Ristin Veripalvelu, p. 029 300 1759
Jarmo Ritari, projektitutkija, Suomen Punaisen Ristin Veripalvelu, p. 029 300 1806
Kuvat
Linkit
Tietoja julkaisijasta
Tilaa tiedotteet sähköpostiisi
Haluatko tietää asioista ensimmäisten joukossa? Kun tilaat tiedotteemme, saat ne sähköpostiisi välittömästi julkaisuhetkellä. Tilauksen voit halutessasi perua milloin tahansa.
Lue lisää julkaisijalta SPR Veripalvelu
Verenluovutusta luvassa Åbo Svenska Teaterin päänäyttämöllä – nuoria miehiä toivotaan pääosaan6.3.2024 10:01:27 EET | Tiedote
Veripalvelu jalkautuu jo seitsemättä kertaa Åbo Svenska Teateriin keskiviikkona 13.3.2024. Verenluovutus teatraalisissa puitteissa on mahdollista klo 12-18. Jokakeväinen tempaus järjestetään tänä vuonna opiskelijayhteistyön hengessä.
Veripalvelu aloitti jälleen plasman keräämisen12.2.2024 13:40:19 EET | Tiedote
Veripalvelussa voi vuosien tauon jälkeen jälleen luovuttaa plasmaa. Plasmasta erotellaan tärkeitä raaka-aineita lääkevalmistukseen, ja plasmaperäisille lääkkeille on kasvava tarve Euroopassa.
Veripalvelussa tehdään vaikeiden palovammojen hoitoon innovatiivista soluvalmistetta23.1.2024 10:45:22 EET | Tiedote
Veripalvelun solutuotantokeskuksessa on tauon jälkeen käynnistetty niin kutsutun autologisen keratinosyyttivalmisteen tuotanto. Kyseessä on palovammojen ja kroonisten haavojen hoitoon tarkoitettu, vaurioituneelle iholle suihkutettava erikoisvalmiste. Valmiste on yhdistelmä potilaan omia, eristettyjä ihosoluja ja kudosliimaa.
Verenluovutus muutti Vantaalle – tavoitteena saada lisää uusia luovuttajia15.1.2024 10:00:00 EET | Tiedote
Verenluovuttajat pääsevät ojentamaan kätensä 15.1.2024 alkaen Veripalvelun uudessa toimipisteessä Vantaalla, kauppakeskus Jumbo-Flamingossa. Uuden, pysyvän sijainnin myötä Veripalvelu pyrkii olemalla läsnä siellä, missä ihmiset liikkuvat sekä samalla laajentamaan luovuttajakuntaa.
Ennätysmäärä potilaita saanut avun Kantasolurekisterin kautta21.12.2023 14:04:23 EET | Tiedote
Vuoden 2023 aikana jo 66 Suomen Kantasolurekisteriin kuuluvaa vapaaehtoista on luovuttanut kantasoluja tuntemattomalle potilaalle. Luovutusten määrä on kasvanut vuoden takaisesta jopa 53 %, sillä vuonna 2022 luovutuksia oli 43. Kantasolusiirrolla hoidetaan vaikeita veritauteja, kuten leukemiaa, sairastavia potilaita. Kyseessä on aina potilaan viimeinen mahdollisuus parantua.
Uutishuoneessa voit lukea tiedotteitamme ja muuta julkaisemaamme materiaalia. Löydät sieltä niin yhteyshenkilöidemme tiedot kuin vapaasti julkaistavissa olevia kuvia ja videoita. Uutishuoneessa voit nähdä myös sosiaalisen median sisältöjä. Kaikki tiedotepalvelussa julkaistu materiaali on vapaasti median käytettävissä.
Tutustu uutishuoneeseemme