Koneoppiminen auttaa ennustamaan leukemian uusiutumista kantasolusiirron jälkeen
SPR Veripalvelu on tutkimuksessaan kartoittanut kantasolusiirron saaneiden potilaiden perimän vaihtelun merkitystä hoidon lopputulokseen. Tulokset antavat viitteitä siitä, että potilaan genomitietoa ja koneoppimista voitaisiin hyödyntää kantasolusiirron riskien arvioinnissa yhä laajemmin.
Veren kantasolujen siirtoa käytetään viimesijaisena hoitokeinona nopeasti eteneviin hematologisiin syöpiin, joihin syöpälääkkeet eivät tehoa. Onnistuneessa allogeenisessa kantasolusiirtohoidossa luovuttajan luuydin korvaa potilaan oman luuytimen ja immuunijärjestelmän tuhoten samalla pahanlaatuiset kasvainsolut.
Vaikka hoitovaste on jatkuvasti parantunut, on kantasolusiirto edelleen vaativa ja vaarallinen toimenpide, jossa hengenvaaralliset komplikaatiot kuten käänteishyljintä tai taudin uusiminen ovat yleisiä. Noin kolmanneksella potilaista syöpä uusii muuten suotuisasta siirrosta huolimatta, eikä tällä hetkellä ole olemassa hyviä genomitietoon pohjautuvia työkaluja ennustaa taudin uusimista.
Luo pohjaa entistä yksilöllisemmälle hoidolle
Veripalvelussa, jossa kaikki ennen siirtoa tehtävät potilaan ja luovuttajan väliset sopivuuskokeet tehdään, on nyt tutkittu siirteen saajan perintötekijöiden osuutta taudin uusimisriskiin. Tutkimuksessa yli 500:n Suomessa kantasolusiirteen saaneen potilaan perimän vaihtelu määritettiin sekvensoimalla ja DNA-sirun avulla.
Vaihtelun yhteyttä taudin uusimiseen hoidon jälkeen tutkittiin laskennallisin ja tilastollisin menetelmin pyrkien huomioimaan esimerkiksi iästä tai siirretyypistä johtuva vaihtelu lopputuloksessa. Potilaat saivat siirteen sisarukseltaan. Koneoppimismalli luotiin 150 potilaan suuruisessa otoksessa ja sen luotettavuutta arvioitiin edelleen kahdessa riippumattomassa potilassarjassa.
Tulosten perusteella tiettyjen perintötekijöiden ja siirronjälkeisen syövän uusiutumisen välillä esiintyy tilastollinen yhteys. Tulevaisuudessa perintötekijöiden jatkotutkimukset voivat auttaa taudin mekanismien selvittämisessä ja potilaan riskin tarkemmassa arvioinnissa.
- Genomitietoa käyttämällä voimme Veripalvelussa jatkossa kehittää yhä parempia kantasolusiirron onnistumista ennakoivia testejä nykyisten rinnalle, toteaa tutkimusjohtaja Jukka Partanen.
Tutkimusprojekti on Suomen Akatemian rahoittama, ja nyt saadut ensimmäiset tulokset on julkaistu alan johtavassa Leukemia-lehdessä. Tutkimus J Ritari ym: Genomic prediction of relapse in recipients of allogeneic haematopoietic stem cell transplantation on luettavissa täältä.
Avainsanat
Yhteyshenkilöt
Jukka Partanen, tutkimusjohtaja, Suomen Punaisen Ristin Veripalvelu, p. 029 300 1759
Jarmo Ritari, projektitutkija, Suomen Punaisen Ristin Veripalvelu, p. 029 300 1806
Kuvat
Linkit
Tietoja julkaisijasta
Tilaa tiedotteet sähköpostiisi
Haluatko tietää asioista ensimmäisten joukossa? Kun tilaat tiedotteemme, saat ne sähköpostiisi välittömästi julkaisuhetkellä. Tilauksen voit halutessasi perua milloin tahansa.
Lue lisää julkaisijalta SPR Veripalvelu
Verenluovuttajat elintärkeitä potilaille17.4.2024 13:44:35 EEST | Tiedote
Verenluovuttajien osuus kaikista Suomen luovutusikäisistä ihmisistä oli viime vuonna vain reilut 3 %. Kymmenen vuoden aikana osuus on vähentynyt noin prosenttiyksiköllä. Luovuttajakunnan laajentaminen on tärkeää varautumisen kannalta.
Hengenpelastajaliigan kauden 2023–24 mestariksi KOOVEE - yli 6000 potilasta sai apua9.4.2024 12:01:38 EEST | Tiedote
Mestiksen ja Veripalvelun jo viidettä vuotta jatkunut yhteistyö on jälleen auttanut tuhansia potilaita. Hengenpelastajaliigan kaudella 2023–24 koko Mestis-yhteisö näytti esimerkkiä luovuttamalla verta yhteensä 2102 kertaa.
Veripalvelun tutkimusapurahat 2024 nyt haettavissa8.4.2024 12:48:49 EEST | Tiedote
Veripalvelun tutkimusrahaston vuoden 2024 apurahojen haku tutkijoille on avautunut. Apurahojen tavoitteena on tukea tutkimusta, joka liittyy Veripalvelun nykyisiin ja tuleviin valmisteisiin ja palveluihin. Hakuaika on 5.4.– 12.5.2024. Apuraha voi olla suurimmillaan jopa 150 000 euroa.
Veripalvelu aloittaa hepatiitti E -viruksen testaamisen verenluovuttajista3.4.2024 11:56:13 EEST | Tiedote
Veripalvelu on aloittanut hepatiitti E -viruksen testaamisen verenluovuttajista, sillä hepatiitti E -tartunnat ovat lisääntyneet maassamme alkuvuoden aikana. Suomessa ei ole raportoitu yhtään verensiirtojen välityksellä tarttunutta hepatiitti E -tapausta, mutta hepatiitti E testataan nyt kuitenkin kaikista verenluovuttajista verivalmisteiden turvallisuuden varmistamiseksi.
Yhä useammat työyhteisöt sallivat verenluovutuksen työajalla19.3.2024 12:58:12 EET | Tiedote
Veripalvelun vuosi sitten lanseeraama työpaikkasertifikaatti on otettu käyttöön jo yli 250 työpaikalla. Sertifikaatti on tunnustus niille työyhteisöille, jotka mahdollistavat verenluovutuksessa käynnin työajalla.
Uutishuoneessa voit lukea tiedotteitamme ja muuta julkaisemaamme materiaalia. Löydät sieltä niin yhteyshenkilöidemme tiedot kuin vapaasti julkaistavissa olevia kuvia ja videoita. Uutishuoneessa voit nähdä myös sosiaalisen median sisältöjä. Kaikki tiedotepalvelussa julkaistu materiaali on vapaasti median käytettävissä.
Tutustu uutishuoneeseemme